ส่วนยุทธศาสตร์ มีภารกิจ ดังนี้
- จัดทำแผนการบริหารจัดการทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมจังหวัด
- จัดทำยุทธศาสตร์กลุ่มจังหวัดและจังหวัด
- ประสานการจัดทำแผนบริหารจัดการ แผนปฏิบัติการด้านทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมกับหน่วยงานราชการ องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น ภาคเอกชน องค์กรอิสระ เครือข่ายการมีส่วนร่วม
- จัดทำคำขอตั้งงบประมาณประจำปีต่อสำนักงานปลัดกรทรวงทรัพยากรธรรมชาติและส่ิงแวดล้อม กลุุ่มจังหวัด จังหวัด องค์กรปกครองส่วนท้องถ่ินและกองทุนต่าง ๆ
- จัดทำรายงานสรุปผลการปฏิบัติงานโครงการต่าง ๆ รวมทั้งรายงานประจำปี
- กำกับ ติดตาม ประเมินผลตามแผนยุทธศาสตร์ แผนงานโครงการ งบประมาณ
- ดำเนินการเกี่ยวกับการพัฒนาระบบสารสนเทศด้านทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม
- ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือทที่ได้รับมอบหมาย